L'UPF participe à plusieurs projets d’envergure (Labex Corail, GOPS, Piurn) au sein desquels elle joue un rôle actif...
Cette démarche de collaboration est d’autant plus indispensable pour l’UPF en raison de sa situation d’isolement et de sa taille restreinte. De plus, dans une région Pacifique qui occupe plus d’un tiers de la surface du globe, comportant un grand nombre d’états indépendants, majoritairement anglophones, chacun distant de plusieurs milliers de kilomètres, toute collaboration est implicitement de dimension internationale. Si pour certaines thématiques, il s’agit de rechercher des compétences extérieures complémentaires, pour d’autres, l’UPF peut représenter un vivier d’expertise.
Les collaborations sont soit initiées autour d’une thématique globale, soit associées à des programmes ou des actions bien précises.
Par exemple, à l’échelle du Pacifique, les différents Etats Insulaires partagent des problématiques communes, toutes thématiques confondues, que l'UPF doit aborder et traiter en partenariat avec les autres organismes de recherche et/ou d’enseignement.
L’UPF, est cofondatrice de deux réseaux de collaborations que sont le GOPS ou le PIURN.
Par ailleurs, dans le domaine des écosystèmes coralliens, fondamental pour la Polynésie, l’UPF est membre d’un laboratoire d’excellence, le Labex-CORAIL, dont le terrain d’action s’étend sur toute la bande tropicale.